Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms