Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms