Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms