Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rmdn3Q3UJU9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms