Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI0

Ccser2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser2Q3UHI0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms