Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garem1Q3UFT3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms