Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zyg11bQ3UFS0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms