Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U595 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U595 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U595 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U595 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U595 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U595 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U595 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U595 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U595 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U595 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U595 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U595 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U595 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U595 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U595 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U595 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U595 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U595 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U595 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U595 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U595 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U595 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U595 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U595 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U595 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U595 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U595 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q3U595 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q3U595 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q3U595 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q3U595 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q3U595 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q3U595 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U595 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U595 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U595 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U595 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U595 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U595 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U595 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U595 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U595 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U595 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U595 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U595 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U595 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U595 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U595 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U595 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U595 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U595 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U595 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U595 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U595 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U595 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U595 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U595 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U595 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U595 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U595 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U595 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U595 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U595 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U595 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U595 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U595 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U595 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U595 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U595 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U595 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U595 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U595 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U595 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U595 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U595 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U595 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U595 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U595 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U595 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U595 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U595 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U595 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U595 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U595 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U595 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q3U595 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q3U595 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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