Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms