Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U1D9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U1D9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U1D9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U1D9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U1D9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Q3U1D9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Q3U1D9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U1D9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U1D9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U1D9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U1D9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U1D9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U1D9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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