Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Palb2Q3U0P1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Palb2Q3U0P1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Palb2Q3U0P1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Palb2Q3U0P1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Palb2Q3U0P1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Palb2Q3U0P1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Palb2Q3U0P1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Palb2Q3U0P1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Palb2Q3U0P1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Palb2Q3U0P1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Palb2Q3U0P1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Palb2Q3U0P1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Palb2Q3U0P1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Palb2Q3U0P1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Palb2Q3U0P1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Palb2Q3U0P1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Palb2Q3U0P1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Palb2Q3U0P1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Palb2Q3U0P1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Palb2Q3U0P1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Palb2Q3U0P1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Palb2Q3U0P1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Palb2Q3U0P1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Palb2Q3U0P1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Palb2Q3U0P1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Palb2Q3U0P1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Palb2Q3U0P1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Palb2Q3U0P1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms