Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms