Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWH3

Pnrc1, MCG12570, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnrc1Q3TWH3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnrc1Q3TWH3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms