Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSG4

Alkbh5, RNA demethylase ALKBH5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh5Q3TSG4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms