Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxw18Q3TSA9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms