Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms