Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarca4Q3TKT4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms