Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc13Q3TIR1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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