Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
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RubcnlQ3TD16 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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RubcnlQ3TD16 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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RubcnlQ3TD16 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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RubcnlQ3TD16 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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RubcnlQ3TD16 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
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RubcnlQ3TD16 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms