Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR3

Pdss2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss2Q33DR3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdss2Q33DR3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdss2Q33DR3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdss2Q33DR3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdss2Q33DR3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdss2Q33DR3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdss2Q33DR3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdss2Q33DR3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdss2Q33DR3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdss2Q33DR3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdss2Q33DR3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdss2Q33DR3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdss2Q33DR3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdss2Q33DR3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdss2Q33DR3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdss2Q33DR3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdss2Q33DR3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdss2Q33DR3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdss2Q33DR3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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