Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms