Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms