Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
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Shroom4Q1W617 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
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Shroom4Q1W617 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
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Shroom4Q1W617 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
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Shroom4Q1W617 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
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Shroom4Q1W617 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
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Shroom4Q1W617 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms