Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc39dQ0VF76 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms