Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBM2

Fam83b, Protein FAM83B, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83bQ0VBM2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam83bQ0VBM2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms