Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem52bQ0VBF2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem52bQ0VBF2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms