Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms