Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pate4Q09098 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pate4Q09098 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pate4Q09098 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pate4Q09098 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pate4Q09098 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pate4Q09098 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pate4Q09098 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pate4Q09098 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pate4Q09098 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pate4Q09098 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pate4Q09098 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pate4Q09098 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pate4Q09098 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pate4Q09098 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pate4Q09098 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms