Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms