Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou6f1Q07916 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms