Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms