Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms