Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPINDOCQ05AH6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.5 ms