Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms