Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelaQ04207 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelaQ04207 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelaQ04207 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelaQ04207 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelaQ04207 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelaQ04207 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelaQ04207 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelaQ04207 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms