Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pfdn6Q03958 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pfdn6Q03958 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pfdn6Q03958 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pfdn6Q03958 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pfdn6Q03958 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pfdn6Q03958 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pfdn6Q03958 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pfdn6Q03958 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pfdn6Q03958 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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