Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms