Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp11Q02853 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp11Q02853 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms