Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp39Q02525 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zfp39Q02525 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zfp39Q02525 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zfp39Q02525 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zfp39Q02525 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zfp39Q02525 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zfp39Q02525 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zfp39Q02525 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zfp39Q02525 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zfp39Q02525 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zfp39Q02525 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp39Q02525 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp39Q02525 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp39Q02525 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp39Q02525 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp39Q02525 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp39Q02525 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp39Q02525 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp39Q02525 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp39Q02525 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp39Q02525 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms