Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VcpQ01853 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VcpQ01853 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VcpQ01853 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VcpQ01853 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VcpQ01853 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VcpQ01853 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VcpQ01853 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VcpQ01853 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms