Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms