Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2aQ01320 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms