Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HmgcrQ01237 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms