Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Grin2bQ01097 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms