Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms