Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp1P97350 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms