Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad50P70388 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad50P70388 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad50P70388 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad50P70388 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad50P70388 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad50P70388 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad50P70388 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad50P70388 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms