Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgif1P70284 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tgif1P70284 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tgif1P70284 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tgif1P70284 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tgif1P70284 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgif1P70284 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgif1P70284 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tgif1P70284 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tgif1P70284 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tgif1P70284 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tgif1P70284 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgif1P70284 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgif1P70284 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tgif1P70284 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgif1P70284 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgif1P70284 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tgif1P70284 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgif1P70284 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgif1P70284 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgif1P70284 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgif1P70284 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgif1P70284 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tgif1P70284 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgif1P70284 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgif1P70284 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgif1P70284 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgif1P70284 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgif1P70284 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgif1P70284 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgif1P70284 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgif1P70284 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgif1P70284 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgif1P70284 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgif1P70284 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgif1P70284 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgif1P70284 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgif1P70284 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tgif1P70284 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgif1P70284 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgif1P70284 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgif1P70284 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tgif1P70284 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgif1P70284 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgif1P70284 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgif1P70284 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms