Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Vamp7P70280 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp7P70280 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms