Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf5P70191 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf5P70191 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf5P70191 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf5P70191 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf5P70191 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf5P70191 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf5P70191 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf5P70191 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf5P70191 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf5P70191 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms